Considérée par beaucoup comme étant l'intelligence artificielle la plus puissante créée par l'humanité, Cortana a été associée à Master Chief dans un ultime effort de l'UNSC pour en finir avec les Covenants. Après la chute du bastion militaire de Reach, Master Chief et Cortana s'enfuirent et trouvèrent Halo. Ils en percèrent les secrets, ce qui les mena à la découverte de l'Arche. Toutes les formes de vies conscientes étant menacées par les Covenants, les Floods et le réseau de halos, Master Chief et Cortana détruisirent l'Arche, mettant ainsi fin au conflit. Par la suite, ils se retrouvèrent tous deux au portes de Requiem, un monde Forerunner d'une puissance effrayante recelant un lugubre secret. Cortana, approchant désormais dangereusement de sa fin de vie opérationnelle, est prête à basculer dans la folie alors qu'est dévoilée la menace posée par ce nouveau monde.
